鹿善继“端方谨悫”，“生而凝重，少不嬉戏”，家人不令其就塾师，而在家中接受祖父的教育。明万历二十二年(公元1594年)八月，鹿善继应顺天乡试，“因场中题未得解，归而旁搜诸家注义，其有采辑王文成公《传习录》中语者，每阅之，则心动”。第二年，他终于得到祖父鹿久征在任上寄送的一部《王文成公全书》，于是取其中《传习录》，“寝食其中，慨然有必为圣贤之志”。明万历三十八年(公元1610年)，同邑薛一鹗孝廉“诬谤之事起”，牵连多人，鹿善继以为，“是可诬也，孰不可诬也”，乃挺身而出，白于新县令胡嘉桂“持勘”，几得雪之。然而转过年来，事情又发生了变故，鹿善继在此事中一展其忠正节义风采。